Our Mission


Gut microbiota, which consists of approximately 1000 bacterial species has a tremendous impact on the biological functions of the host. Our research focuses on the gut microbiota - immune cells interactions of human, rodents, and non-human primates. We aim to identify specific intestinal bacterial species that influence the host immune cells by inducing their functions and differentiation. By unraveling the mechanisms and key bacterial molecules, we strive to develop therapeutic intervention for healing wide-array of intestinal dysibiosis, such as inflammatory bowel disease, auto-immune diseases and allergy. 









2022.04 Ann Rev Immに、Columbia大 Ivaylo Ivanovらとの総説を発表しました。"T cell responses to the microbiota" was published in Ann Rev Imm. Ivanov I, Tuganbaev T, Skelly A, Honda K, Ann Rev Imm 2022.


2021.11 Natureに、佐藤、新らによる百寿者に特徴的な胆汁酸産生菌に関する論文を発表しました。新しい胆汁酸合成経路を明らかにしました。"Novel bile acid biosynthetic pathways are enriched in the microbiome of centenarians" was published in Nature.  Sato Y, Atarashi K, Plichta D et al., Nature 2021.


2020.04 CellのVoicesにLive Bacterial Cocktail Therapyについてコメント発表。Honda K "Live Bacterial Cocktail Therapy" was published in Cell,  Voices, Translating Microbiome Research into Therapies: The Path Ahead, Cell. 2020


2019.12 本田、新が米国クラリベイト・アナリティクス社発表の ”Highly Cited Researchers 2018” に6年連続で選ばれました。Kenya was selected for the 2019 list of Highly Cited Researchers by Clarivate Analytics.→Highly Cited Researchers 2019


2019.03 Nature Reviews Immunologyに、Skelly、佐藤、Kearney、本田らによるマイクロバイオームに関する総説を発表しました。"Mining the microbiota for microbial and metabolite-based immunotherapies" was published in Nature Reviews Immunology.  Skelly AN, Sato Y, Kearney S, Honda K, Nature Reviews Immunology. 2019


2019.01 Natureに、田之上、森田らによるVE800(CD8 T細胞を誘導する11菌株)に関する論文を発表しました。"A defined commensal consortium elicits CD8 T cells and anti-cancer immunity" about VE808 (11 mix inducing CD8 T cells) was published in Nature.  Tanoue T and Morita S et al., Nature 2019.


2018.12 本田が米国クラリベイト・アナリティクス社発表の ”Highly Cited Researchers 2018” に5年連続で選ばれました。Kenya was selected for the 2018 list of Highly Cited Researchers by Clarivate Analytics.→Highly Cited Researchers 2018


2018.12 Vedanta Biosciences社とBristol-Myers Squibb社が “VE800” に関するライセンス契約を締結しました。Bristol-Myers Squibb and Vedanta Biosciences Announce a New Clinical Collaboration to Evaluate OPDIVO® (nivolumab) and VE800 in Patients with Advanced or Metastatic Cancers.→Press Release


2018.11 炎症性腸疾患(IBD)に対する治療候補薬である経口投与型LBD “VE202” のPhase1臨床試験が始まりました。Vedanta Biosciences Announces Initiation of Phase 1 Clinical Study with Janssen of Microbiome-Derived Product Candidate for Inflammatory Bowel Disease.→Press Release


2018.09 Nature Biotechnology誌発表の “Top 20 translational researchers of 2017” に本田・田之上・新がランクインしました。Takeshi, Kenya, and Koji was placed in the list of “Top 20 translational researchers of 2017” published by Nature Biotechnology. →Top 20 translational researchers of 2017


2018.06 本田が「北里」を受賞しました。Kenya received the "Kitazato Award".


2018.06 本田が慶応医学部3年生から選出される「ベストティーチャー」に選出されました。Kenya was selected as "The Best Teacher" among sophomores of Keio University School of Medicine.  


2018.04 U-MassのVanni Bucciらのとの、腸内細菌ダイナミクスのシミュレーションに関する論文がElife に掲載されました。Our collaboration with Vanni Buccie (U-Mass) on "Computer-guided design of optimal microbial consortia for immune system modulation" was published in ELife. Stein RR and Tanoue T et al., Elife 2018. 


2017.11 本田が米国クラリベイト・アナリティクス社発表のHighly Cited Researchers 2017-影響力の高い科学者2017年版-に4年連続で選出されました。Kenya was selected for the 2017 list of Highly Cited Researchers by Clarivate Analytics as one of the world's most influential scientific minds.   

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2017.10 Th1細胞に関する論文がScienceに掲載されました。Our work on "Ectopic colonisation of oral bacteria in the intestine drives TH1 cell induction and inflammation" was published in Science. Atarashi K et al., Science 2017.


2016.11 本田が「第53回(2016年度)ベルツ賞」を受賞しました。Kenya was awarded with the "53rd Annual Erwin von Bälz Prize" from Boehringer Ingelheim. 


2016.10 本田が「平成28年度 持田記念学術賞」を受賞しました。Kenya received the "Academic Award of the Mochida Memorial Foundation".


2016.07 Natureにマイクロバイオームと獲得免疫系に関する総説を発表しました。Our review article on "The microbiota in adaptive immune homeostasis and diseases" was published in Nature. Honda K and Littman DR, Nature 2016


2016.03 van den Brink M (Memorial Sloan Kettering Cancer Center), Reddy P (University of Michigan)とのGVHDに関する共同研究がNature Immunologyに掲載されました。"Gut microbiome-derived metabolites modulate intestinal epithelial cell damage and mitigate graft-versus-host disease", a collaborative work with van den Brink M and Reddy P got accepted to Nature Immunology. Mathewson ND et al., Nature Immunology 2016.


2016.02 本田が「第32回井上学術賞」を受賞しました。Kenya was awarded with the "32nd Inoue Prize for Science".


2015.11 本田が「第18回(平成27年)日本免疫学会賞」を受賞しました。Kenya received the "18th Japanese Society of Immunology Award".


2015.09 Th17細胞に関する論文がCellに掲載されました。Our work on "Th17 cell induction by adhesion of microbes to intestinal epithelial cells" was published in CellAtarashi K et al., Cell 2015


2014.11 本田が「第1回 野村達次賞」を受賞しました。Kenya received the "1st Tatsuji Nomura Award" from The Keio Medical Society. 


2014.06.18  本田・新・田之上が「ゴットフリート・ワグネル賞2014優秀賞」を受賞しました。Kenya, Koji and Takeshi received the "Gottfried Wagener Prize- German Innovation Award".


2014.07.01 本田が慶應義塾大学医学部微生物学免疫学教室に着任しました。Kenya was appointed as a Professor of the Department of Microbiology and Immunology at Keio University School of Medicine. 



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